RAPTOR

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RAPTOR
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版本: 4.5
上传日期: 28 May 15
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Rating: 3.9/5 (Total Votes: 7)

RAPTOR是专为精确蛋白质结构预测的创新软件。它结合了先进的分析工具于一体的综合软件解决方案,并提供了三种不同的线程方法。 RAPTOR独特整数规划优化方法是最有效的用于查找的低序列同源性目标结构的模板,并且能够产生高质量的模型。易于使用的界面和易于理解的Ë值非常适合初学者和专家。首先,直观的显示输出使用户能够理解的结果只是一目了然。给定靶蛋白序列,如果存在具有已知三维结构的同源蛋白质,它可以通过使用序列搜索工具,如PSI-BLAST时,在RAPTOR还提供找到。目标的结构,然后从已知的结构建;然而,当序列同源性不显著,即低于25%,PSI-BLAST不能拿出一个自信的打击。不像PSI-BLAST,它只是做了搜索序列,蛋白质线程,折叠识别,利用两者的同源性和结构的信息。它扫描具有未知结构与已知结构的数据库中的蛋白质序列。通过使用计分函数,并进行三维结构和线性蛋白质序列之间的相容性的分析,最好​​的结构模板将被确​​定从中生成所述序列的结构。其结果是,蛋白质线程给出了一个优越的预测比同源建模时有边际的序列同源性

限制

功能有限

支持的操作系统

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意见 RAPTOR

1 注释
  • reza 23 Feb 21
    غیر از این نسخه 2015
    نسخه بروز تزی وجود نداره ؟
    و کار این نرم افزار چیه؟
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